近年来,免疫检查点抑制剂(比如大家熟知的 PD-1/PD-L1 抑制剂)为癌症治疗带来了革命性突破,但遗憾的是,多数实体瘤患者对这类治疗反应不佳。关键问题就藏在肿瘤免疫微环境(tumor immune microenvironment, TIME) 里 —— 这里就像一个混乱的 “战场”,免疫细胞之间的 “交流” 被严重干扰,导致杀伤肿瘤的 T 细胞 “失明”“失能”。
其中,肿瘤相关巨噬细胞(tumor-associated macrophages, TAMs) 是微环境里的 “关键角色”。正常情况下,它们像 “免疫哨兵” 一样,会捕捉肿瘤细胞的 “坏分子”(抗原),并通过 “展示牌”(主要组织相容性复合体 I 类分子,MHC-I)把信息传递给 T 细胞,让 T 细胞精准打击肿瘤。但在很多肿瘤中,TAMs 会 “叛变”,不仅不传递信息,还会释放抑制信号,让 T 细胞 “罢工”。
研究团队发现,Parkin 蛋白正是让 TAMs “叛变” 的关键。
在小鼠实验中,敲除Parkin基因后,奇迹发生了:
图 1. 小鼠体内 Parkin 缺失可减轻多种癌症的肿瘤负荷。(A和B)野生型(WT)和Park2基因敲除(Park2−/−)小鼠接种皮下MC38肿瘤后的肿瘤体积(A)和生存率(B)。 (C和D)野生型(WT)和Park2基因敲除(Park2−/−)小鼠接种皮下Hepa1-6肿瘤后的肿瘤体积(C)和生存率(D)。(E)肝细胞癌原位模型中野生型(WT)和Park2基因敲除(Park2−/−)小鼠的生存分析。(F)肝细胞癌肿瘤的代表性图像。(G)野生型(WT)和Park2基因敲除(Park2−/−)小鼠颅内接种CT2A胶质瘤细胞后的总生存率(OS)曲线。GBM,多形性胶质母细胞瘤。(H)小鼠颅内肿瘤的代表性组织学图像(箭头指示肿瘤)。图像为每只指定动物至少3张图像中的代表性图像。(I)通过单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析的40091个细胞的t分布随机邻域嵌入(t-SNE)图,这些细胞来自接种MC38肿瘤的野生型或Park2基因敲除小鼠(每组2只小鼠的细胞合并)。DCs,树突状细胞。(J)(I)中主要细胞类型的比例。(K)野生型或Park2基因敲除小鼠皮下MC38肿瘤中T细胞、CD8+ T细胞和CD4+ T细胞的百分比。(L和M)野生型和Park2基因敲除小鼠肿瘤间质液中的IL-2(L)和IFN-γ(M)水平。(N至P)接受(N)磷酸盐缓冲盐水(PBS)、(O)抗CD4抗体和(P)抗CD8抗体处理的野生型和Park2基因敲除MC38荷瘤小鼠的肿瘤体积。图中已标注小鼠数量。
更有趣的是,当特异性敲除巨噬细胞中的 Parkin 时,同样能看到肿瘤被抑制的效果。这说明,巨噬细胞里的 Parkin 是导致免疫抑制的 “主谋”。
图3. Parkin缺陷增强巨噬细胞功能及T细胞活化。(A)带注释的UMAP图,显示对野生型(WT)和Park2基因敲除(Park2−/−)小鼠肿瘤中髓系细胞的单细胞RNA测序(scRNA-seq)分析结果。(B和C)野生型和Park2基因敲除小鼠中CD8+ T细胞与髓系细胞间相互作用的强度差异。(D) scRNA-seq数据集中,接种MC38肿瘤的野生型和Park2基因敲除小鼠的肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)中选定基因的表达水平热图。(E)接种MC38细胞后,接受抗集落刺激因子1受体(抗CSF1R)抗体处理或未处理的野生型和Park2基因敲除小鼠的肿瘤体积。图中已标注小鼠数量。(F)对照小鼠(Ctrl)和Park2fl/fl-Lyz2-Cre+/−小鼠接种皮下MC38肿瘤后的肿瘤体积。CKO,条件性敲除。(G)对照小鼠或Park2fl/fl-Lyz2-Cre+/−小鼠皮下MC38肿瘤中T细胞、CD8+ T细胞的百分比。(H)实验设计。(I)接种Hepa1-6细胞并移植野生型或Park2基因敲除骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)的野生型小鼠的肿瘤体积。图中已标注小鼠数量。(J)基于scRNA-seq数据集,对野生型和Park2基因敲除小鼠肿瘤中巨噬细胞的转录本进行分析,评估共刺激、抗原呈递、炎症和M1型巨噬细胞特征的富集程度。(K)基于MC38模型的scRNA-seq分析,显示野生型或Park2基因敲除小鼠的TAMs与T细胞亚群之间选定配体-受体对相互作用的气泡热图。
Parkin 原本的工作是 “清理” 细胞里受损的线粒体(线粒体自噬),但在肿瘤微环境中,它干起了 “破坏免疫” 的勾当。
研究发现,肿瘤微环境中能量代谢紊乱,会激活一种叫 AMPK 的 “能量感知蛋白”。AMPK 会给 Parkin “发信号”,让它激活。激活后的 Parkin 会通过一种叫 ATG5 的蛋白启动 “自噬程序”,而这个程序会 “偷偷” 降解巨噬细胞表面的 MHC-I 分子 —— 就像把 “展示牌” 藏了起来,T 细胞接收不到肿瘤信息,自然无法发起攻击。
图 4. Parkin 抑制巨噬细胞的抗原呈递。(A)对Park2基因敲除(Park2−/−)小鼠中macro_CD80和macro_C1qc巨噬细胞亚群中上调基因的富集分析。GO_BP,基因本体论:生物学过程;GO_CC,基因本体论:细胞组分;GO_MF,基因本体论:分子功能。TAP,TAP蛋白是由TAP1和TAP2亚基组成的异二聚体肽转运蛋白。(B)野生型(黑色)或Park2基因敲除(红色)macro_CD80和macro_C1qc巨噬细胞中促炎症和MHC-I抗原呈递特征富集分数的经验累积分布函数(ECDF)图。(C)M1型巨噬细胞特征中选定基因的点图。(D)抗原呈递特征中选定基因的点图。(E)用骨髓来源巨噬细胞(BMDMs)刺激的OT-I T细胞的代表性图像和比例。(F)皮下MC38肿瘤中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的MHC-I表达。(G和H)用TAMs刺激72小时后的OT-I T细胞的代表性图像和比例(G),或对照小鼠和Park2fl/fl-Lyz2-Cre+/−小鼠的OT-I T细胞的代表性图像和比例(H)。(I)与BMDMs共培养后,IFN-γ+ OT-I T细胞的代表性图像和比例。(J)与TAMs共培养72小时后,OT-I T细胞分泌的IFN-γ水平。(K)bulk RNA-seq数据集中,野生型和Park2基因敲除小鼠MC38肿瘤中与IFN-γ产生相关的基因表达水平热图。(L)经IFN-γ阻断的野生型和Park2基因敲除MC38荷瘤小鼠的肿瘤体积。图中已标注小鼠数量。(M)野生型或Park2基因敲除肿瘤浸润淋巴细胞(TILs)中的有效克隆性。(N)野生型(黑色)或Park2基因敲除(红色)T细胞中记忆T细胞特征富集分数的ECDF图。(O)记忆T细胞特征中选定基因的点图。(P)野生型或无瘤Park2基因敲除小鼠在接受5倍数量Hepa1-6细胞再次攻击后的肿瘤生长情况。
图 5. AMPK 依赖的 Parkin 激活通过自噬抑制 MHC-I 呈递。(A 和 B)野生型(WT)和 Pink1 基因敲除(Pink1−/−)小鼠接种皮下 MC38 肿瘤后的肿瘤生长(A)和总生存率(OS)(B)。(C 和 D)对照细胞和过表达全长 Parkin 的 Raw264.7 细胞的代表性图像(C)和 MHC-I 表面水平(D)。Comp-FL2-A,补偿信号荧光通道 2 面积;PE-A,藻红蛋白面积参数。(E)对照细胞和过表达全长 Parkin 的 Raw264.7 细胞中 Parkin 和 MHC-I 的总细胞水平。GAPDH,甘油醛 - 3 - 磷酸脱氢酶。(F)对照细胞、过表达全长 Parkin 的细胞以及过表达 Parkin S65A、S108A 和 C430S 突变体的 Raw264.7 细胞的 MHC-I 表面水平。(G)免疫亚群中 AMPK 信号通路的表达和活性。(H)过表达全长 Parkin、Parkin S65A、S108A 和 C430S 突变体的 Raw264.7 细胞在未处理(NC)或经 AMPK 抑制剂(AMPKi)处理后的 MHC-I 表面水平。(I 和 J)对照细胞和过表达全长 Parkin 的 Raw264.7 细胞中 H2-K1(I)和 H2-Q1(J)的 mRNA 表达水平。(K)对照细胞和过表达全长 Parkin 的 Raw264.7 细胞在未处理或经自噬抑制剂 [氯喹(CQ)和巴佛洛霉素 A1(BafA1)] 处理后的 MHC-I 表面水平。(L 和 M)经 BafA1 处理的对照细胞和过表达全长 Parkin 的 Raw264.7 细胞中 MHC-I 表达的蛋白质印迹分析。(N)野生型和 Atg5fl/fl-Lyz2-Cre+/−小鼠接种皮下 MC38 肿瘤后的肿瘤生长。(O)MC38 肿瘤中 T 细胞的代表性图像和百分比。(P)对照小鼠和 Atg5fl/fl-Lyz2-Cre+/−小鼠 MC38 肿瘤中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的 MHC-I 表达。(Q)用 TAMs 刺激 72 小时后,增殖的 OT-I T 细胞的代表性图像和比例。
更关键的是,这个过程和 Parkin 在帕金森病中的经典作用(依赖 PINK1 蛋白的线粒体自噬)完全不同,是一条全新的 “作恶路径”。
这项研究不仅揭示了 Parkin 的新功能,还为癌症治疗提供了新思路:
联合治疗更有效:敲除 Parkin 后,小鼠对 PD-L1 抑制剂的反应明显增强。这意味着,抑制 Parkin 可能让更多患者从免疫治疗中受益。
预测预后的 “指示器”:分析人类肿瘤数据发现,Parkin 低表达的患者,体内杀伤性 T 细胞更多,预后更好。基于此构建的 “Parkin 缺失特征”,能有效预测多种实体瘤患者的生存期。
跨界研究的启发:Parkin 同时关联帕金森病和肿瘤,提示两种看似无关的疾病可能存在共同的分子机制。未来或许能通过调节 Parkin,同时为神经退行性疾病和癌症提供新疗法。
图 6. Parkin 缺失增强免疫检查点阻断(ICB)治疗的疗效,且 Parkin 是癌症免疫治疗的潜在靶点。(A)不同肿瘤中 Park2 的表达与活化 CD8⁺T 细胞浸润的相关性分析。UCS,子宫癌肉瘤;THCA,甲状腺癌;SARC,肉瘤;PRAD,前列腺腺癌;LGG,低级别胶质瘤;KIRP,肾乳头状细胞癌;KIRC,肾透明细胞癌;HNSC,头颈部鳞状细胞癌;GBM,多形性胶质母细胞瘤;COAD,结肠腺癌;BRCA,乳腺浸润性癌;BLCA,膀胱尿路上皮癌。(B)接受新辅助抗 PD-1 治疗的转移性尿路上皮癌(mUC)患者中 Park2 的表达。(C)野生型(WT)和 Park2 基因敲除(Park2⁻/⁻)MC38 荷瘤小鼠在第 9、12、15 和 18 天腹腔注射抗小鼠 PD-L1 抗体或未处理后的肿瘤体积。图中已标注小鼠数量。(D 至 K)Park2⁻/⁻特征评分与腺样囊性癌(ACC)(D)、乳腺癌(BRCA)(E)、结肠腺癌(COAD)(F)、肝细胞癌(LIHC)(G)、前列腺腺癌(PRAD)(H)、直肠腺癌(READ)(I)、皮肤 cutaneous 黑色素瘤(SKCM)(J)和胃腺癌(STAD)(K)患者的总生存率(OS)、疾病特异性生存率(DSS)和无进展间隔期(PFI)的相关性。低 Park2⁻/⁻特征,蓝色曲线;高 Park2⁻/⁻特征,红色曲线。
从保护神经到帮助肿瘤逃避免疫,Parkin 的 “双面人生” 提醒我们:人体的分子机制远比想象中复杂。而每一个这样的发现,都在为破解疾病谜题、开发新疗法添砖加瓦。
或许在不久的将来,针对 Parkin 的药物能与免疫治疗联手,让更多肿瘤患者迎来曙光。而这一切,都始于对一个 “老蛋白” 的全新认识。
研究所用的Lyz2-Cre小鼠来自鼠来宝生物。
原文链接 https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.adn8402