鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma, NPC)的治疗主要依赖于放疗和顺铂(Cisplatin)基础的化疗,然而约30%的患者因获得性耐药而治疗失败,成为临床治疗的主要瓶颈。来自华中科技大学的研究团队发表于《Cell Death & Differentiation》(IF = 13.7)的相关研究揭示了一个全新的表观遗传调控轴:USP7/KDM5B/ZBTB16/TOP2A,通过调控鼻咽癌增殖及顺铂耐药的分子机制,明确了关键调控节点的功能及相互作用,为临床开发顺铂增敏策略提供了全新的理论依据和潜在靶点。鼠来宝生物为这项研究提供了BALB/c裸鼠。

鼻咽癌是一种具有地域特异性的恶性肿瘤,局部晚期患者的标准治疗方案为顺铂为基础的放化疗联合治疗。然而,约30%的患者会因获得性顺铂耐药导致治疗失败,这是目前鼻咽癌治疗面临的主要瓶颈。
近年来,表观遗传调控被证实与多种癌症的化疗耐药密切相关,且具有可逆性,为耐药逆转提供了潜在靶点。赖氨酸特异性去甲基化酶5B(KDM5B)可通过催化H3K4me2/3去甲基化调控基因表达,参与细胞干性、DNA 修复和肿瘤免疫等多种细胞过程,但它在鼻咽癌顺铂耐药中的作用及调控机制尚未明确。拓扑异构酶 Ⅱα(TOP2A)作为铂类化疗耐药的关键分子,其表达调控机制也有待进一步阐明。
研究揭示了USP7/KDM5B/ZBTB16/TOP2A轴在鼻咽癌顺铂耐药中的核心调控作用,明确了KDM5B的上游稳定机制及下游信号通路,为临床开发鼻咽癌顺铂增敏治疗策略提供了新的分子靶点(如KDM5B、USP7),具有重要的理论价值和临床转化潜力。
(1) 候选基因筛选:通过生物信息学分析MSigDB、GSE118719、GSE53819数据库,筛选鼻咽癌中高表达的组蛋白甲基修饰酶,锁定核心分子KDM5B。
(2) KDM5B功能验证:体内外实验(细胞增殖、侵袭、凋亡、移植瘤模型)验证KDM5B对鼻咽癌进展及顺铂耐药的影响。
(3) 下游通路解析:通过RNA-seq、ChIP-Atlas预测结合实验验证,明确 KDM5B→ZBTB16→TOP2A 的调控链。
(4) 上游调控机制探索:利用UbiBrowser 预测、Co-IP、GST pulldown等实验,鉴定 KDM5B 的去泛素化酶USP7,验证其对 KDM5B 的稳定作用。
(5) 通路完整性验证:通过基因沉默/过表达、抑制剂干预(USP7抑制剂P5091、KDM5B抑制剂AS-8351),在体内外验证USP7/KDM5B/ZBTB16/TOP2A轴对顺铂耐药的调控作用。

生物信息学分析显示,KDM5B在鼻咽癌组织中显著高表达。
细胞实验:沉默KDM5B可抑制鼻咽癌HNE1、CNE2细胞增殖、侵袭,增强顺铂诱导的凋亡,降低顺铂IC50值;过表达KDM5B则相反。
动物实验:沉默KDM5B可显著抑制裸鼠移植瘤生长,且增强顺铂的抗肿瘤效果。

图1. 异常的KDM5B表达促进NPC细胞的增殖、侵入和顺铂耐药性
RNA-seq显示,沉默KDM5B后ZBTB16显著上调,且NPC患者样本中KDM5B与ZBTB16表达呈负相关。
ChIP-qPCR验证:KDM5B直接结合ZBTB16启动子区域,沉默KDM5B可增强该区域H3K4me3的结合水平,提示KDM5B通过去除ZBTB16启动子区域的H3K4me3甲基化,抑制其转录表达。

图2. KDM5B负向调控NPC中的ZBTB16表达
生物信息学预测及验证:ZBTB16直接结合TOP2A启动子,沉默ZBTB16可上调 TOP2A 表达,且NPC患者样本中ZBTB16与TOP2A呈负相关。
功能回复实验:沉默ZBTB16可逆转沉默KDM5B对鼻咽癌增殖、侵袭及顺铂耐药的抑制作用,而过表达ZBTB16则增强顺铂敏感性。
蛋白相互作用:Co-IP、GST pulldown证实USP7与KDM5B直接结合,且结合依赖KDM5B的KXXXK基序。
调控机制:沉默USP7或使用USP7抑制剂P5091,可降低KDM5B蛋白水平(mRNA 无变化),缩短KDM5B蛋白半衰期,增加其泛素化水平;MG132(蛋白酶体抑制剂)可逆转该效应,表明USP7通过去泛素化抑制KDM5B降解。
临床相关性:鼻咽癌组织芯片中USP7与KDM5B表达呈正相关。

图6. USP7通过去泛素化KDM5B促进了NPC中KDM5B蛋白的稳定性
轴调控的完整性验证:沉默USP7或使用P5091,可下调KDM5B、TOP2A,上调ZBTB16;过表达USP7则相反;同时沉默USP7和KDM5B,TOP2A表达进一步降低。
耐药逆转效应:细胞实验中,P5091与顺铂联合使用可显著降低顺铂IC50值,增强凋亡诱导效应;动物实验中,P5091联合顺铂可显著抑制移植瘤生长,且沉默TOP2A可进一步增强该效果。

图7. USP7/KDM5B/ZBTB16/TOP2A轴调节NPC细胞中的顺铂抗性
机制创新:首次揭示USP7-KDM5B-ZBTB16-TOP2A轴调控鼻咽癌顺铂耐药的完整通路,明确表观遗传修饰(H3K4me3去甲基化)与泛素化修饰(去泛素化稳定)的协同作用,填补了鼻咽癌耐药机制研究的空白。
靶点明确:验证了USP7、KDM5B、TOP2A为鼻咽癌顺铂耐药的关键靶点,且USP7抑制剂P5091、KDM5B抑制剂可增强顺铂敏感性,为临床联合用药提供了具体候选药物。
验证全面:从生物信息学筛选、细胞功能验证、分子机制解析,到临床组织芯片验证、动物体内实验,多层面、多维度证实核心结论,结果可靠性高。
临床价值:明确了KDM5B、USP7、TOP2A在鼻咽癌组织中的高表达及相关性,为患者耐药风险评估提供了潜在生物标志物。
5. 结语
该研究不仅揭示了KDM5B在鼻咽癌化疗耐药中的核心作用,还提出了通过抑制USP7来破坏KDM5B稳定性的新策略,为改善鼻咽癌患者的预后提供了新的分子靶点。

项目中用到的4-5周龄BALB/c裸鼠由鼠来宝生物提供。
参考资料
Zhang, B., Li, J., Wang, Y. et al. Cell Death Differ 31, 309–321 (2024).
https://doi.org/10.1038/s41418-024-01257-x